公司秘密地改变了我们之间的劳动合同，我可以申请劳动仲裁吗？

您可以申请劳动仲裁。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，因变更劳动合同发生的的争议可申请仲裁。《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》规定，不及时处理可能导致权益受损且难以维权。
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对公司秘密改变劳动合同的情况，您可以采取以下措施：1.与公司沟通，要求恢复或重新签订合同；2.如沟通无果，向劳动监察部门投诉；3.提起劳动仲裁，根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，维护自己的的合法权益。
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您可以通过与用人单位协商，或向劳动争议调解委员会申请调解，也可以直接向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请。《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》鼓励协商解决劳动争议。选择处理方式时，应考虑效率和实际情况。